MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 plasmid pLAtc3

Total Repeats: 645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015854	TGTT	2	8	21641	21648	0 %	75 %	25 %	0 %	340783911
502	NC_015854	GAA	2	6	21716	21721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783911
503	NC_015854	GGT	2	6	21734	21739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783911
504	NC_015854	CTTT	2	8	21743	21750	0 %	75 %	0 %	25 %	340783911
505	NC_015854	TCTA	2	8	21795	21802	25 %	50 %	0 %	25 %	340783911
506	NC_015854	TGAT	2	8	21849	21856	25 %	50 %	25 %	0 %	340783911
507	NC_015854	CGT	2	6	21866	21871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783911
508	NC_015854	ATT	2	6	21930	21935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783911
509	NC_015854	CAC	2	6	21962	21967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783911
510	NC_015854	CTG	2	6	22049	22054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783911
511	NC_015854	CGC	2	6	22058	22063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783911
512	NC_015854	CAA	2	6	22064	22069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783911
513	NC_015854	CCA	2	6	22116	22121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783912
514	NC_015854	AG	3	6	22127	22132	50 %	0 %	50 %	0 %	340783912
515	NC_015854	GTA	2	6	22163	22168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783912
516	NC_015854	ATAA	2	8	22344	22351	75 %	25 %	0 %	0 %	340783912
517	NC_015854	ACGTC	2	10	22408	22417	20 %	20 %	20 %	40 %	340783912
518	NC_015854	AACT	2	8	22499	22506	50 %	25 %	0 %	25 %	340783912
519	NC_015854	ATT	2	6	22533	22538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783912
520	NC_015854	TTG	2	6	22696	22701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783912
521	NC_015854	TCA	2	6	22752	22757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783912
522	NC_015854	GTC	2	6	22793	22798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783912
523	NC_015854	CAA	2	6	22900	22905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015854	T	6	6	22922	22927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015854	A	6	6	22939	22944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015854	CGA	2	6	22961	22966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015854	AGT	2	6	23005	23010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015854	TCG	2	6	23045	23050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015854	GCG	3	9	23109	23117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015854	TGT	2	6	23308	23313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015854	AAGAT	2	10	23329	23338	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015854	CG	3	6	23389	23394	0 %	0 %	50 %	50 %	340783913
533	NC_015854	GAA	2	6	23440	23445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783913
534	NC_015854	GTC	2	6	23549	23554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783913
535	NC_015854	CGTT	2	8	23576	23583	0 %	50 %	25 %	25 %	340783913
536	NC_015854	ACC	3	9	23660	23668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783913
537	NC_015854	CGG	3	9	23757	23765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783913
538	NC_015854	CG	3	6	23767	23772	0 %	0 %	50 %	50 %	340783913
539	NC_015854	TGA	2	6	23799	23804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783913
540	NC_015854	CCTC	2	8	23892	23899	0 %	25 %	0 %	75 %	340783913
541	NC_015854	TGG	2	6	24009	24014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783914
542	NC_015854	GGA	2	6	24041	24046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783914
543	NC_015854	GTC	3	9	24130	24138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783914
544	NC_015854	GCTGCA	2	12	24174	24185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783914
545	NC_015854	GCG	2	6	24212	24217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783914
546	NC_015854	GTT	2	6	24439	24444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783915
547	NC_015854	CAG	2	6	24501	24506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783915
548	NC_015854	CTG	2	6	24545	24550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783915
549	NC_015854	TGC	2	6	24644	24649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783916
550	NC_015854	CTC	2	6	24674	24679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783916
551	NC_015854	GA	3	6	24681	24686	50 %	0 %	50 %	0 %	340783916
552	NC_015854	GC	3	6	24717	24722	0 %	0 %	50 %	50 %	340783916
553	NC_015854	CCT	2	6	24735	24740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783916
554	NC_015854	C	6	6	24774	24779	0 %	0 %	0 %	100 %	340783916
555	NC_015854	TCC	2	6	24780	24785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783916
556	NC_015854	GAGGAT	2	12	24794	24805	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	340783916
557	NC_015854	GCC	2	6	24829	24834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783916
558	NC_015854	ACCT	2	8	24908	24915	25 %	25 %	0 %	50 %	340783916
559	NC_015854	ATC	2	6	24953	24958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783916
560	NC_015854	CCA	2	6	25020	25025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_015854	ATG	2	6	25034	25039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015854	CA	3	6	25042	25047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_015854	CTAT	2	8	25062	25069	25 %	50 %	0 %	25 %	340783917
564	NC_015854	TTC	2	6	25094	25099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783917
565	NC_015854	GCT	2	6	25149	25154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783917
566	NC_015854	CCT	2	6	25359	25364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783918
567	NC_015854	TGC	2	6	25390	25395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783918
568	NC_015854	TCG	2	6	25441	25446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783918
569	NC_015854	ACC	2	6	25451	25456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783918
570	NC_015854	CCA	2	6	25599	25604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783918
571	NC_015854	GTCA	2	8	25615	25622	25 %	25 %	25 %	25 %	340783918
572	NC_015854	CCT	2	6	25665	25670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783918
573	NC_015854	GCC	2	6	25755	25760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783918
574	NC_015854	CTA	2	6	25782	25787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783918
575	NC_015854	TGT	2	6	25792	25797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783918
576	NC_015854	CGC	2	6	25829	25834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783918
577	NC_015854	GGC	2	6	25849	25854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783918
578	NC_015854	TGG	2	6	25929	25934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783918
579	NC_015854	ACA	2	6	25998	26003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_015854	AT	3	6	26033	26038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015854	TA	3	6	26052	26057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015854	TAA	3	9	26059	26067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015854	TAGA	2	8	26072	26079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015854	TAA	2	6	26086	26091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015854	GCC	2	6	26111	26116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_015854	ACC	2	6	26254	26259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_015854	GGT	3	9	26269	26277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015854	GCA	2	6	26286	26291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015854	CAC	2	6	26318	26323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_015854	CGTG	2	8	26437	26444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_015854	GC	3	6	26448	26453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_015854	TC	3	6	26456	26461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_015854	CCCA	2	8	26471	26478	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
594	NC_015854	CTG	2	6	26536	26541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015854	TGG	2	6	26545	26550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015854	CTG	2	6	26635	26640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783919
597	NC_015854	G	6	6	26688	26693	0 %	0 %	100 %	0 %	340783919
598	NC_015854	TCAAGC	2	12	26705	26716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340783919
599	NC_015854	CTGCC	2	10	26902	26911	0 %	20 %	20 %	60 %	340783919
600	NC_015854	CTC	2	6	26956	26961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783919
601	NC_015854	TGCC	2	8	26969	26976	0 %	25 %	25 %	50 %	340783919
602	NC_015854	CGC	2	6	27018	27023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783919
603	NC_015854	TGG	2	6	27026	27031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783919
604	NC_015854	CCG	2	6	27047	27052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783919
605	NC_015854	TCG	2	6	27116	27121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783919
606	NC_015854	GC	3	6	27222	27227	0 %	0 %	50 %	50 %	340783919
607	NC_015854	GCA	2	6	27260	27265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783919
608	NC_015854	ACC	2	6	27317	27322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783919
609	NC_015854	GCG	2	6	27373	27378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783919
610	NC_015854	CGC	2	6	27408	27413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783919
611	NC_015854	CCA	3	9	27470	27478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783919
612	NC_015854	CGG	2	6	27509	27514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783919
613	NC_015854	GAA	2	6	27516	27521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783919
614	NC_015854	AGG	2	6	27539	27544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783919
615	NC_015854	CAT	2	6	27597	27602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783919
616	NC_015854	ACA	2	6	27608	27613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783919
617	NC_015854	CGA	2	6	27642	27647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783919
618	NC_015854	CGC	2	6	27661	27666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783919
619	NC_015854	GC	3	6	27844	27849	0 %	0 %	50 %	50 %	340783919
620	NC_015854	C	7	7	27877	27883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
621	NC_015854	C	7	7	27892	27898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
622	NC_015854	GGT	2	6	27958	27963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015854	CTT	2	6	28016	28021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_015854	AGG	2	6	28126	28131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015854	TGC	2	6	28170	28175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015854	GGTC	2	8	28259	28266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_015854	CTTT	2	8	28275	28282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_015854	GGT	2	6	28489	28494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015854	CCG	2	6	28583	28588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_015854	CGC	2	6	28594	28599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_015854	TGC	2	6	28634	28639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015854	ATGCC	2	10	28688	28697	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
633	NC_015854	AGGC	2	8	28828	28835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_015854	AGGC	2	8	28863	28870	25 %	0 %	50 %	25 %	340783920
635	NC_015854	CGGA	2	8	28961	28968	25 %	0 %	50 %	25 %	340783920
636	NC_015854	TCT	2	6	28992	28997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783920
637	NC_015854	CCA	2	6	29156	29161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783920
638	NC_015854	A	6	6	29236	29241	100 %	0 %	0 %	0 %	340783920
639	NC_015854	AAT	2	6	29388	29393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783920
640	NC_015854	GCC	2	6	29404	29409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783920
641	NC_015854	AGGT	2	8	29474	29481	25 %	25 %	50 %	0 %	340783920
642	NC_015854	GCA	2	6	29489	29494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783920
643	NC_015854	GCC	2	6	29512	29517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783920
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645	NC_015854	AAG	2	6	29557	29562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783920

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